Emerging and re-emerging viruses

Description

Les virus émergents, et ré-émergents constituent un élément majeur parmi les différents agents pathogènes responsables d’épidémies récentes, comme en témoignent les nombreux épisodes récents d’Ebola, chikungunya, grippe, Zika, dengue, SARS ou MERS, ainsi que les épisodes affectant les animaux tels la rage ou la fièvre catarrhale ovine.
Le présent MOOC présente les différents virus impliqués dans l’émergence virale, et décrit les mécanismes moléculaires et conditions responsables d’une telle émergence. Ceux-ci s’étendent tant à l’apparition de mutations qu’aux conséquences des changements climatiques, jusqu’à l’impact de l’urbanisation et des changements d’activités et de comportements humains.

Une mention spéciale sera faite sur l’approche “Santé Globale” (“One Health”). Ce MOOC fournira également des bases d’épidémiologie virale et de modélisation des épidémies, ainsi que sur la détection, les mesures sanitaires précoces et les mécanismes de contrôle des épidémies. Il portera également sur les stratégies scientifiques et médicales pour prévenir et lutter contre l’émergence virale, et apportera une vision sur la réponse des gouvernements et agences internationales, telle l’Organisation Mondiale de la Santé (O.M.S.), pour contrer et maîtriser les épidémies.
Ce MOOC s’appuie sur l’expérience reconnue d’experts internationaux dans le domaine et les activités du Réseau International des Instituts Pasteur.

Format

Le MOOC est divisé en 7 chapitres de 4 à 8 sessions. Chaque session comporte une courte vidéo et 2 questions à choix multiple pour tester votre compréhension de la session. A la fin de chaque chapitre, 10 à 16 questions à choix multiple (en anglais) vous seront posées. Un examen de certification (en anglais) est proposé aux étudiants inscrits au parcours Qualifiant. Les vidéos sont en anglais, sous-titrées en anglais et en français.

Pour suivre ce cours, vous avez le choix entre deux formules : formule DECOUVERTE qui vous permettra de vous familiariser avec le sujet grâce aux vidéos, quiz et accès aux forums et formule QUALIFIANTE dans laquelle vous pourrez acquérir un certificat.

Parcours Découverte

Si vous optez pour cette formule, vous aurez accès aux vidéos du cours, aux quiz et aux échanges dans les forums. Ce parcours ne donnera pas lieu à la délivrance d'une attestation. Les inscriptions, gratuites, sont possibles dès à présent et ne sont soumises à aucune condition.

Parcours Qualifiant

En complément des activités proposées dans la formule DECOUVERTE, la formule QUALIFIANTE vous permettra d'obtenir une attestation sous la forme d'un "certificat". Pour cela, vous devrez suivre un examen individuel final surveillé à distance d’une durée de 1 heure, consistant en 30 questions à choix multiples (QCM) et d'obtenir 20 bonnes réponses. Vous aurez également accès à des hangouts.

Prérequis

Un bon niveau scientifique est recommandé pour suivre ce MOOC (licence en sciences de la vie).

Evaluation et Certification

Attention, seule la formule "Qualifiante" donne droit à une certification qualifiante délivrée par Fun et l'institut Pasteur. Par ailleurs, il n'y aura pas d'attestation de suivi avec succès, ni pour la formule "Découverte", ni pour la formule "Qualifiante".

Plan de cours

Chapitre 1 - Introduction
- W1-1 : Introduction générale (Albert Osterhaus, Amsterdam)
  W1-2 : Définitions : émergents et ré-emergents (Antoine Gessain, Institut Pasteur)
  W1-3 : Principes : vecteurs, hôtes, réservoirs... (Anna-Bella Failloux, Institut Pasteur)
  W1-4 : Santé globale (Hervé Bourhy, Institut Pasteur)
Chapitre 2 - Mécanismes moléculaires qui conduisent à l’émergence ou la ré-émergence d’un virus
- W2-1 : Nouveaux virus identifiés (Marc Eloit, Institut Pasteur)
  W2-2 : La grippe aviaire (Jean-Claude Manuguerra, Institut Pasteur)
  W2-3 : Virus précédemment connus qui ont acquis des caractères de virulence supplémentaires: virus grippaux 1 et 2 (Sylvie van der Werf, Institut Pasteur)
  W2-4: Contrôle de l'hôte sur le virus (Carla Saleh, Institut Pasteur)
Chapitre 3 - Conditions qui favorisent l’émergence ou la ré-émergence d’un virus
- W3-1 : Changements dans l'urbanisation, le comportement humain (Pascal Handschumacher UNISTRA)
  W3-2 : Changements climatiques, déforestation, catastrophes naturelles (Joacim Rocklöv (Université d’Umea, Sweden)
  W3-3 : Coronavirus : SARS, MERS-CoV (Luis Enjuanes, Madrid)
  W3-4 : Fièvre jaune (Nolween Jouvenet, Institut Pasteur)
  W3-5 : Hantavirus et fièvre de Lassa (Noel Tordo, Institut Pasteur)
  W3-6 : Le contact humain-non humain avec les primates comme moteur de l'émergence virale (Tamara Gilles-Vernick)
  W3-7 : Une expérience de 20 ans de la circulation de la fièvre catarrhale du mouton en Europe (Damien Vitour)
Chapitre 4 - Santé globale.
- W4-1: Maladies à Bornavirus (Hilde Angermeier, Institut Pasteur EUPHEM)
  W4-2: Le virus Nipah (Birgit Nikolai)
  W4-3: La Dengue (Marie Flamand, Institut Pasteur)
  W4-4: La fièvre de la vallée du Rift (Benjamin Brennan, Glascow)
  W4-5: Virus Crimée-Congo (Claudia Filippone, Institut Pasteur Madagascar)
  W4-6: L'hépatite E (Nicole Pavio, ANSES Maisons-Alfort)
Chapitre 5 - Épidémiologie et modélisations.
- W5-1: Phylogénie et virus (Noël Tordo, Institut Pasteur)
  W5-2: L'épidémiologie de Zika (Arnaud Fontanet, Institut Pasteur)
  W5-3: L'épidémiologie de l'hépatite C en Egypte (Arnaud Fontanet, Institut Pasteur)
  W5-4: Épidémie de virus Ebola: du terrain au laboratoire(Christophe Peyrefitte, Institut Pasteur Dakar)
  W5-5: Quasi-Espèces et virus (Esteban Domingo, Madrid)
  W5-6: Modélisation de l'épidémiologie de l'infection virale (Simon Cauchemez, Institut Pasteur)
Chapitre 6 - Détection, prise en charge et contrôle de l'infection.
- W6-1 : Surveillance des vecteurs (Norbert Becker, Heidelberg)
  W6-2 : Surveillance des maladies virales(Harold Noël, Santé Publique France)
  W6-3 : Epidémiologie moléculaire (Antoine Gessain, Institut Pasteur)
  W6-4 : CIBU et Arbovirus (Jessica Vanhomwegen, Institut Pasteur)
Chapitre 7 - Prévention et réponse aux virus émergents.
- W7-1: Activités de contrôle des vecteurs (Norbert Becker, Heidelberg)
  W7-2: Enseignements tirés du bioterrorisme du passé et approche stratégique des antiviraux à orthopoxvirus (Christophe Peyrefitte, Institut Pasteur Dakar)
  W7-3: Préparation (Marie-Paule Kieny, Inserm)
  W7-4: Un exemple : OITF de l'IP(Eileen Farnon/Amber Kunkel/Jean-Claude Manuguerra)
  W7-5: Action de santé publique: de la science à la politique (Didier Houssin, DGS)
  W7-6: Vaccins (Frédéric Tangy, Institut Pasteur)
  W7-7: Therapeutique (Etienne Decroly, AFMB Polytech, Luminy)
  W7-8: Liste OMS des maladies prioritaires (Marie-Paule Kieny, WHO)